Cy2是一种绿色荧光的染料。它是Cy系列染料中 一个以苯并恶唑为发色团的染料，正因为如此，尽管它有和Cy3相同长度的次甲基桥链，但是它的吸收峰和发射峰蓝移了约70 nm,到达黄绿色光谱区，使它成为Cy系列菁染料中 一个发绿色荧光的染料。Cy2有很多优点，在非极性和极性环境中荧光都很强，可以支持DPX和Permount等非极性有机封片剂，荧光核化学结构较稳定，可适配各种常规仪器的绿色荧光通道，可标记各种纳米材料和生物样品等。
CY为花菁 (Cyanine) 的缩写，经典的菁染料含有两个含氮杂环，分子内部含有由甲川基 (CH) n 组成的共轭链，n 可为奇数或偶数。这一特性对它们的电子结构可显著的影响电子基态下的平衡结构，共轭链两端或链中间连有杂环、芳环化合物、环烯化合物等与共轭链组成一个大的共轭体系，分子内部的氢可被一定数目的各类取代基取代。CY 系类染料常被用于蛋白，抗体以及小分子化合物的标记，对于蛋白抗体的标记，可以通过简单的混合反应来完成结合。
Cy系列属于花菁类染料，其中Cy SE是非水溶性形式，Sulfo-Cy SE是磺酸化的高水溶性形式。